Aguilar ist verkehrstechnisch gut erschlossen. Die Stadt liegt direkt an der Autobahn A-45, die Córdoba mit Málaga verbindet. Ein regionaler Bahnhof ermöglicht Zugverbindungen in Richtung Córdoba, Puente Genil und Sevilla.
Der nächstgelegene Flughafen ist Córdoba (ca. 50 km), größere internationale Flughäfen befinden sich in Málaga und Sevilla, jeweils etwa 100–120 km entfernt. Von dort aus ist Aguilar bequem mit Mietwagen oder Fernbus erreichbar.
Innerhalb der Stadt ist vieles fußläufig erreichbar. Es gibt auch ein kleines städtisches Bussystem sowie Taxis. Für Ausflüge in die Umgebung bieten sich Fahrradverleih oder Mietwagen an.