Almendralejo liegt im Süden der Autonomen Gemeinschaft Extremadura, etwa 60 km südöstlich von Badajoz und 30 km südlich von Mérida. Die Stadt befindet sich in der fruchtbaren Ebene „Tierra de Barros“, einem bedeutenden landwirtschaftlichen Gebiet. Sie liegt im Landesinneren und ist umgeben von sanften Hügeln, Olivenhainen und weitläufigen Weinbergen.
Wichtige geografische Bezugspunkte in der Nähe sind die Stadt Mérida mit ihren römischen Monumenten (UNESCO-Weltkulturerbe) und der Fluss Guadiana. Die Lage an der wichtigen Nord-Süd-Verbindung A-66 (Via de la Plata) macht Almendralejo besonders gut erreichbar.
Das Klima ist mediterran-kontinental geprägt, mit heißen, trockenen Sommern und milden Wintern. Die beste Reisezeit ist zwischen April und Juni sowie im September und Oktober, wenn die Temperaturen angenehm sind und zahlreiche Veranstaltungen stattfinden.