Azuqueca de Henares liegt im Zentrum Spaniens, in einer der wirtschaftlich dynamischsten Regionen des Landes – dem Henares-Korridor. Die Stadt befindet sich etwa 47 Kilometer nordöstlich von Madrid und 15 Kilometer südwestlich der Provinzhauptstadt Guadalajara. Sie liegt in einer fruchtbaren Talebene entlang des Flusses Henares, eingebettet zwischen sanften Hügeln und landwirtschaftlichen Flächen.
Dank der Nähe zur Hauptstadt Madrid ist Azuqueca hervorragend angebunden und bietet gleichzeitig eine ruhigere und entspanntere Atmosphäre als die Metropole. Geografisch profitiert die Stadt von ihrer zentralen Lage und der Nähe zu historischen Städten wie Alcalá de Henares (UNESCO-Welterbe) sowie zu Naturschutzgebieten in der Sierra de Ayllón.
Das Klima ist kontinental-mediterran, mit heißen Sommern und kühlen Wintern. Die angenehmsten Reisezeiten sind Frühling und Herbst, wenn milde Temperaturen und geringe Niederschläge ideale Bedingungen für Stadtbesichtigungen und Outdoor-Events bieten.