Jaén liegt im Südosten Spaniens, in der autonomen Gemeinschaft Andalusien, etwa 90 Kilometer nordöstlich von Granada. Die Stadt befindet sich im Landesinneren, auf einer Hochebene am Fuße der Sierra de Jabalcuz, umgeben von den weiten Olivenhainen der Provinz – der weltweit größten zusammenhängenden Anbaufläche für Oliven.
Wichtige Städte wie Córdoba, Sevilla und Málaga sind mit Auto oder Zug gut erreichbar. In unmittelbarer Nähe befinden sich bedeutende Naturgebiete wie der Naturpark Sierra de Cazorla, Segura y Las Villas, einer der größten Naturparks Spaniens und ein beliebtes Ziel für Outdoor-Aktivitäten.
Das Klima ist mediterran-kontinental mit heißen, trockenen Sommern und milden Wintern. In den Sommermonaten können die Temperaturen über 35 °C steigen, während der Winter eher gemäßigt ist. Die besten Reisezeiten sind Frühling und Herbst, wenn die Temperaturen angenehmer sind und sich die Landschaft in ihrer schönsten Form zeigt.