Der wichtigste Wirtschaftszweig in Jaén ist die Landwirtschaft, insbesondere die Olivenölproduktion. Die Stadt ist das Zentrum des weltweit größten Olivenanbaugebiets, was sich nicht nur in der Wirtschaft, sondern auch im kulturellen Selbstverständnis der Region widerspiegelt. Zahlreiche Kooperativen, Mühlen und Produzenten bieten Führungen und Verkostungen an.
Neben der Landwirtschaft gewinnt der Tourismus zunehmend an Bedeutung, vor allem im Bereich Kulturtourismus, Ökotourismus und gastronomischer Reisen. Jaén bietet vielfältige Möglichkeiten für Besucher, die das ursprüngliche Andalusien kennenlernen möchten.
Auch der Bildungssektor, vor allem durch die Universität Jaén, spielt eine bedeutende Rolle. Die Universität zieht Studierende aus ganz Spanien und international an, was zur wirtschaftlichen und kulturellen Dynamik der Stadt beiträgt.