Die nächstgelegene Verkehrsanbindung bietet der Flughafen von Almería, der etwa 30 Autominuten von Níjar entfernt liegt. Von hier aus gibt es regelmäßige Inlandsflüge sowie Verbindungen zu europäischen Städten wie London oder Brüssel.
Die Anreise mit dem Auto ist durch die gut ausgebaute Autobahn A-7 einfach möglich. Mehrere Buslinien verbinden Níjar mit Almería sowie mit den umliegenden Küstenorten.
Innerhalb des Gemeindegebiets empfiehlt sich die Nutzung eines Mietwagens, um auch abgelegene Strände und Sehenswürdigkeiten zu erreichen. In San José und anderen Orten sind zudem Fahrräder und E-Scooter beliebte Fortbewegungsmittel.