Die Wirtschaft Rota’s basiert vor allem auf Tourismus, Landwirtschaft und Fischerei. Als Urlaubsziel zieht die Stadt sowohl nationale als auch internationale Gäste an, was einen wichtigen Beitrag zur lokalen Ökonomie leistet. Besonders in den Sommermonaten floriert der Hotel- und Gastronomiebereich.
Ein weiterer bedeutender Wirtschaftszweig ist die Landwirtschaft. In der Umgebung von Rota werden unter anderem Obst, Gemüse und Wein angebaut. Die Nähe zur renommierten Weinstadt Jerez de la Frontera macht sich auch in Rota bemerkbar, wo regionale Weine und Sherry geschätzt werden.
Die Fischerei spielt weiterhin eine Rolle – viele Restaurants beziehen ihren Fisch frisch von den lokalen Märkten. Besonders die „Urta a la Roteña“, ein traditionelles Fischgericht, hat ihren Ursprung in der hiesigen Küche.
Eine Besonderheit ist die Präsenz der US-Militärbasis (Naval Station Rota), die sowohl wirtschaftlich als auch kulturell Einfluss auf die Stadt nimmt. Sie schafft Arbeitsplätze und bringt internationale Einflüsse in das lokale Leben.