San Roque ist hervorragend erreichbar. Nur 15 Minuten entfernt liegt der Flughafen Gibraltar, der regelmäßige Verbindungen nach Großbritannien bietet. Der Flughafen Málaga ist ca. 90 Minuten entfernt und bietet zahlreiche internationale Flüge.
Die Stadt verfügt über einen eigenen Bahnhof (San Roque-La Línea), der Verbindungen nach Algeciras, Ronda, Córdoba und anderen Städten Andalusiens bietet. Auch das Straßennetz ist sehr gut ausgebaut, mit direktem Anschluss an die Autobahn A-7.
Innerhalb der Stadt und zu den umliegenden Stadtteilen verkehren regelmäßig Busse. Für Besucher steht eine gute Infrastruktur mit Taxis, Parkplätzen und Mietwagen zur Verfügung, die die Mobilität angenehm einfach gestalten.