Die Wirtschaft von Puente-Genil basiert vor allem auf Landwirtschaft, insbesondere auf dem Olivenanbau und der Olivenölproduktion. Die Region produziert einige der besten Olivenöle Spaniens, die auch international exportiert werden. Daneben spielt der Anbau von Gemüse und Obst eine bedeutende Rolle.
Ein weiterer wichtiger Wirtschaftszweig ist die Süßwarenindustrie. Puente-Genil ist besonders bekannt für seine handgemachten Turrones (Nougat-Spezialitäten), die vor allem zur Weihnachtszeit in ganz Spanien beliebt sind. Viele dieser Betriebe sind familiengeführt und haben eine jahrzehntelange Tradition.
Zunehmend gewinnt auch der Tourismus an Bedeutung. Der authentische Charakter der Stadt, die kulturellen Veranstaltungen und die gastronomischen Highlights locken jährlich mehr Besucher an. Zudem entstehen neue Angebote im Bereich nachhaltiger Tourismus und regionaler Erlebnisreisen.