Die Wirtschaft von Loja basiert hauptsächlich auf Landwirtschaft, insbesondere dem Olivenanbau. Das Olivenöl aus Loja gehört zu den hochwertigsten der Region und ist ein wichtiges Exportgut. Daneben spielt der Anbau von Mandeln und Gemüse eine wichtige Rolle.
Der Tourismussektor befindet sich im Aufschwung, wobei vor allem nachhaltiger und ländlicher Tourismus gefördert wird. Auch kleine Handwerksbetriebe, wie Töpferwerkstätten und Textilmanufakturen, sind typisch für Loja und tragen zur lokalen Identität bei.
In jüngerer Zeit wurden Initiativen zur wirtschaftlichen Diversifizierung ins Leben gerufen, um Innovation und unternehmerisches Handeln zu fördern – mit Fokus auf kulturelle Dienstleistungen, Gastronomie und Erlebnisangebote.