Almonte ist gut mit dem Auto über die Autobahn A-49 erreichbar, die Sevilla mit Huelva verbindet. Der nächstgelegene internationale Flughafen befindet sich in Sevilla (etwa eine Stunde Fahrtzeit), während auch Faro (Portugal) eine Option ist.
Zugverbindungen bestehen über Huelva und Sevilla, von wo aus Busse oder private Transfers nach Almonte organisiert werden können. Während der Wallfahrt El Rocío werden spezielle Verkehrsregelungen, Shuttles und temporäre Parkplätze eingerichtet.
Innerhalb von Almonte und den umliegenden Dörfern ist die Mobilität mit dem Auto, Taxi oder Fahrrad unkompliziert. In den Naturgebieten und am Strand sind markierte Wege und Routen vorhanden.