Die Wirtschaft von Las Cabezas de San Juan wird hauptsächlich von der Landwirtschaft getragen. Der Anbau von Getreide, Sonnenblumen und Oliven dominiert das Landschaftsbild und prägt die lokale Identität.
Zunehmend entwickelt sich auch der ländliche Tourismus als wichtige Einnahmequelle. Besucher können landwirtschaftliche Betriebe besichtigen, regionale Produkte probieren und das traditionelle Leben hautnah erleben.
Einige kleine Manufakturen produzieren handgemachte Produkte wie Keramik, Textilien und Olivenöl, die sich sowohl bei Einheimischen als auch bei Touristen großer Beliebtheit erfreuen.