Die Anreise nach Santa Margarita ist unkompliziert. Der Flughafen Palma de Mallorca ist nur rund 50 Kilometer entfernt und bietet zahlreiche Direktverbindungen aus ganz Europa. Von dort aus gelangt man mit dem Mietwagen oder dem Linienbus (TIB) bequem in die Stadt.
Die nächstgelegene Bahnstation befindet sich in Sa Pobla, etwa 15 Kilometer entfernt. Von dort aus bestehen regelmäßige Busverbindungen nach Santa Margarita und seinen Küstenorten.
Innerhalb der Gemeinde sind die Wege kurz. Der Ortskern ist fußgängerfreundlich, und auch zwischen den Ortsteilen verkehren regelmäßig Busse. Für Ausflüge bietet sich das Fahrrad als praktisches und naturnahes Fortbewegungsmittel an.