Portugalete ist hervorragend an das Verkehrsnetz angebunden. Die Stadt liegt an der Linie 2 der Metro Bilbao, mit der man in etwa 20 Minuten das Stadtzentrum von Bilbao erreicht. Zudem ist Portugalete Teil des RENFE-Vorortzugnetzes und wird von zahlreichen Buslinien angefahren.
Der internationale Flughafen Bilbao ist nur etwa 25 Kilometer entfernt und in weniger als 30 Minuten erreichbar. Von dort bestehen Verbindungen zu zahlreichen Städten in Europa und darüber hinaus. Innerhalb der Stadt ist der öffentliche Nahverkehr gut ausgebaut, ergänzt durch Aufzüge und Rolltreppen, die die hügelige Topografie erleichtern.
Die Fußgängerzonen und Fahrradwege machen das Fortbewegen angenehm und sicher. Besonders attraktiv ist auch die Nutzung der Schwebefähre der Puente de Vizcaya, die Portugalete mit Getxo verbindet und gleichzeitig ein Erlebnis für sich ist.