Azkoitia liegt im Norden Spaniens, im autonomen Baskenland, etwa 40 Kilometer südwestlich von San Sebastián. Die Stadt befindet sich im Tal des Flusses Urola, eingebettet zwischen grünen Hügeln und dem imposanten Aizkorri-Gebirge, das sich hervorragend für Outdoor-Aktivitäten und Naturerlebnisse eignet.
Geografisch ist Azkoitia eine Inlandstadt, jedoch nicht weit von der Atlantikküste entfernt. San Sebastián und seine berühmten Strände sind in etwa einer Stunde erreichbar, ebenso wie Bilbao mit seinem internationalen Flughafen. Die Stadt liegt strategisch günstig zwischen Natur, Kultur und Großstadt.
Das Klima ist atlantisch gemäßigt: milde Winter, angenehme Sommer und ganzjährig relativ hohe Niederschläge. Der Frühling und der frühe Herbst sind die besten Reisezeiten – die Natur zeigt sich dann besonders grün, die Temperaturen sind angenehm und viele lokale Veranstaltungen finden in dieser Zeit statt.