Azpeitia ist gut erreichbar – sowohl mit dem Auto als auch mit öffentlichen Verkehrsmitteln. Die nächstgelegenen Flughäfen sind San Sebastián (ca. 60 km entfernt) und Bilbao (ca. 80 km entfernt), die zahlreiche nationale und internationale Verbindungen bieten.
Busverbindungen verbinden Azpeitia regelmäßig mit San Sebastián, Zumarraga und anderen Städten in Gipuzkoa. Eine Besonderheit ist die Museumsbahn des Eisenbahnmuseums, die zwischen Azpeitia und Lasao verkehrt – ein nostalgisches Erlebnis.
In der Stadt selbst kann man sich bequem zu Fuß oder mit dem Fahrrad bewegen. Es gibt ein gut ausgebautes Netz an Fußwegen, sowie eine zunehmende Förderung von nachhaltiger Mobilität durch Radwege und Carsharing-Projekte.