Elgóibar ist verkehrstechnisch hervorragend angebunden. Die Stadt liegt an der Autobahn AP-8, die Bilbao mit San Sebastián verbindet. Somit ist sie sowohl mit dem Auto als auch mit öffentlichen Verkehrsmitteln gut erreichbar.
Die nächstgelegenen Flughäfen sind Bilbao und San Sebastián. Beide bieten nationale und internationale Verbindungen. Vom Flughafen Bilbao aus ist Elgóibar in etwa 45 Minuten erreichbar.
Die Stadt wird außerdem von der Regionalbahn Euskotren bedient, die Verbindungen in nahegelegene Städte wie Eibar, Durango oder San Sebastián ermöglicht. Innerhalb der Stadt sorgen Buslinien und ein gut ausgebautes Fuß- und Radwegenetz für einfache Mobilität.