Irún ist hervorragend angebunden – sowohl für Reisende aus Spanien als auch aus Frankreich oder dem übrigen Europa. Die Stadt liegt an der Autobahn AP-8 und ist Endpunkt der Hochgeschwindigkeits-Bahnlinie (Renfe) sowie Startpunkt der französischen SNCF-Linie. Die Zugverbindung nach Hendaye (nur wenige Minuten entfernt) verbindet Irún direkt mit dem TGV-Netz.
Der Flughafen von San Sebastián ist nur etwa 5 Kilometer entfernt, während die internationalen Flughäfen in Biarritz (Frankreich) und Bilbao ebenfalls gut erreichbar sind. Regionale Busse und Fernbusse verbinden Irún mit den wichtigsten Städten im Baskenland und darüber hinaus.
Innerhalb der Stadt gibt es ein effizientes öffentliches Verkehrsnetz mit Bussen, Fahrradverleihsystemen und Fußwegen. Die kompakte Struktur der Stadt macht es leicht, sich zu orientieren und bequem von Ort zu Ort zu gelangen.