Die heutige Wirtschaft Palafrugells basiert hauptsächlich auf dem Tourismus. Die Stadt profitiert stark von der Attraktivität der Costa Brava und zieht jährlich Tausende von Besucherinnen und Besuchern an. Touristische Dienstleistungen, Gastronomie und Hotellerie bilden das Rückgrat der lokalen Wirtschaft.
Historisch spielte die Korkindustrie eine bedeutende Rolle, und auch heute noch existieren einige kleine Werkstätten und Unternehmen, die diesen Rohstoff weiterverarbeiten oder als kulturelles Gut erhalten.
Weitere wirtschaftliche Schwerpunkte sind der Einzelhandel, die lokale Landwirtschaft (insbesondere Olivenöl, Wein, Obst und Gemüse) sowie kunsthandwerkliche Produkte wie Keramik und Textilien. Wochenmärkte und regionale Produkte verleihen der Stadt ein authentisches Flair.