Die Stadt verfügt über einen eigenen Flughafen (Badajoz-Talavera la Real), der regelmäßige Verbindungen zu den spanischen Metropolen Madrid und Barcelona bietet. Für internationale Besucher ist der Flughafen von Lissabon eine praktikable Alternative, da er nur etwa zwei Autostunden entfernt liegt.
Badajoz ist außerdem gut an das spanische Straßennetz angebunden, insbesondere über die Autobahn A-5 (Madrid–Lissabon). Der Bahnhof bietet regelmäßige Zugverbindungen innerhalb der Region und in andere Teile Spaniens. Auch Fernbuslinien verkehren häufig zwischen Badajoz, Mérida, Cáceres und weiteren Städten.
Innerhalb der Stadt sorgt ein gut ausgebautes Netz öffentlicher Busse für Mobilität. Zusätzlich gibt es Fahrradverleihstationen, zahlreiche Taxis und barrierefreie Verkehrswege, die auch für größere Besuchergruppen geeignet sind.