Alcalá de Henares liegt im Zentrum Spaniens, östlich der Hauptstadt Madrid, und gehört zur Provinz Madrid. Die Stadt befindet sich im Landesinneren, in der Ebene des Henares-Tals, das vom gleichnamigen Fluss durchzogen wird. Diese Lage macht sie zu einem logistisch günstigen Knotenpunkt mit hervorragenden Verbindungen in alle Richtungen.
Die Nähe zu Madrid (ca. 35 km) macht Alcalá zu einer idealen Basis für Tagesausflüge oder als alternative Übernachtungsoption zur Hauptstadt. In der Umgebung befinden sich bedeutende Städte wie Guadalajara und historische Sehenswürdigkeiten wie der Klosterpalast von El Escorial. Auch die Gebirge der Sierra de Guadarrama sind nicht weit entfernt.
Das Klima in Alcalá de Henares ist kontinental geprägt: heiße, trockene Sommer und kühle Winter. Die besten Reisezeiten sind Frühling (April bis Juni) und Herbst (September bis Oktober), wenn die Temperaturen angenehm und die kulturellen Veranstaltungen zahlreich sind.