Manzanares el Real liegt im Norden der Autonomen Gemeinschaft Madrid, eingebettet in die beeindruckende Bergwelt der Sierra de Guadarrama. Die Stadt befindet sich am Fuße des Gebirgsmassivs La Pedriza, das Teil des gleichnamigen Nationalparks ist. In der Nähe fließt der Fluss Manzanares, der auch durch die Hauptstadt Madrid verläuft, und der Stausee Embalse de Santillana bietet idyllische Wasserlandschaften.
Madrid liegt nur etwa 50 Kilometer südlich, was die Stadt sowohl für Tagesausflüge als auch für längere Aufenthalte attraktiv macht. Weitere nahegelegene Städte sind Colmenar Viejo und Soto del Real. Die Umgebung ist geprägt von Berglandschaft, Wanderwegen, Felsformationen und geschützten Naturgebieten.
Das Klima ist kontinental mit mediterranem Einfluss: heiße, trockene Sommer und kalte, aber sonnige Winter. Die besten Reisezeiten sind Frühling und Herbst, wenn die Temperaturen angenehm sind und die Natur in voller Blüte steht. Auch im Sommer ist das Klima hier dank der Höhenlage milder als in Madrid.