San Agustín de Guadalix liegt im Norden der Autonomen Gemeinschaft Madrid, etwa 35 Kilometer von der spanischen Hauptstadt entfernt. Die Stadt befindet sich in einer Hügellandschaft am Ufer des Flusses Guadalix, in der Nähe der Sierra de Guadarrama – einer der bedeutendsten Gebirgsketten Zentralsapaniens.
Dank ihrer Lage an der Autobahn A-1 (Madrid–Burgos) ist San Agustín hervorragend mit Madrid und anderen Städten der Region verbunden. Die Umgebung ist geprägt von Korkeichenwäldern, Naturpfaden und einer mediterranen Vegetation, die der Stadt ein besonders idyllisches Flair verleiht.
Das Klima ist kontinental-mediterran: Heiße Sommer mit Temperaturen über 30 °C und kalte, aber trockene Winter. Die besten Reisezeiten sind Frühling (April–Juni) und Herbst (September–Oktober), wenn das Wetter mild und angenehm ist – ideal für Veranstaltungen im Freien und Naturerkundungen.