San Pedro del Pinatar ist sehr gut erreichbar. Der nächstgelegene Flughafen ist der internationale Flughafen Murcia-Corvera, etwa 35 Autominuten entfernt. Der Flughafen Alicante-Elche ist ebenfalls in etwa einer Stunde erreichbar und bietet eine größere Auswahl an internationalen Verbindungen.
Autofahrer erreichen die Stadt bequem über die Autobahn AP-7 oder die Schnellstraße RM-1. Regionalbusse verbinden San Pedro regelmäßig mit Murcia, Cartagena und den umliegenden Städten und Dörfern.
Innerhalb der Stadt gibt es lokale Buslinien, Taxis sowie Fahrradverleih-Services. Die kompakte Stadtstruktur und gut ausgebaute Rad- und Fußwege machen es leicht, sich ohne Auto fortzubewegen – besonders entlang der Küste und durch den Naturpark.