Die Wirtschaft von Santomera basiert vor allem auf der Landwirtschaft. Die Region ist bekannt für ihre Zitronenplantagen, Olivenhaine und den Anbau von Gemüse. Der Export von Zitronen spielt eine wichtige Rolle für den lokalen Wohlstand.
Neben der Landwirtschaft entwickelt sich auch der Dienstleistungssektor weiter, insbesondere in den Bereichen Handel, Gastronomie und ländlicher Tourismus. Kleine Handwerksbetriebe und Familienunternehmen prägen die wirtschaftliche Struktur der Stadt.
Typisch für die Region sind auch lokale Produkte wie Olivenöl, eingelegtes Gemüse und traditionelle Backwaren. Diese finden auf dem Wochenmarkt und in Feinkostläden regelmäßig Abnehmer – sowohl bei Einheimischen als auch bei Touristen.