Maliaño ist hervorragend an das nationale und internationale Verkehrsnetz angeschlossen. Der Flughafen Santander (Seve Ballesteros), der sich direkt in Maliaño befindet, bietet tägliche Verbindungen zu vielen spanischen und europäischen Städten. Dadurch ist die Stadt besonders attraktiv für internationale Gäste und Geschäftsreisende.
Zudem verfügt Maliaño über einen Bahnhof mit Anbindung an das Regional- und Nahverkehrsnetz von RENFE und FEVE. Santander ist mit dem Zug oder Bus in weniger als 15 Minuten erreichbar. Auch das Straßennetz ist gut ausgebaut – die Autobahn A-8 verläuft in unmittelbarer Nähe.
Innerhalb der Stadt erleichtern Buslinien und Fahrradwege die Fortbewegung. Die überschaubare Größe von Maliaño ermöglicht es, viele Wege zu Fuß zurückzulegen – ideal für Veranstaltungen oder touristische Erkundungen ohne aufwändige Logistik.