Santa María de Cayón ist gut erreichbar: Der Flughafen Santander liegt nur rund 30 Kilometer entfernt und bietet regelmäßige Verbindungen in viele europäische Städte. Vom Flughafen aus ist der Ort mit dem Auto oder Regionalbus in etwa 30–40 Minuten erreichbar.
Auch das Straßennetz ist hervorragend ausgebaut. Über die Autobahn A-8 und die Landstraße CA-142 gelangt man schnell in die umliegenden Städte. Öffentliche Busverbindungen verbinden die Ortsteile untereinander sowie mit größeren Zentren wie Torrelavega oder Santander.
Innerhalb des Gemeindegebiets ist die Fortbewegung unkompliziert. Viele Wege lassen sich zu Fuß oder mit dem Fahrrad zurücklegen, und es gibt ausreichend Parkmöglichkeiten. Für Gruppenreisen oder Events können private Busse organisiert werden.