Die Küche von Santoña ist ein Paradies für Liebhaber frischer Meeresfrüchte. Der unangefochtene Star ist die Sardelle – „Anchoa de Santoña“ – die nach traditionellen Methoden gesalzen und in Olivenöl eingelegt wird.
Typische Gerichte sind außerdem „Marmitako“ (ein Eintopf mit Thunfisch und Kartoffeln), Meeresfrüchte in allen Variationen sowie „Cocido Montañés“, ein herzhaftes Bohnengericht mit Fleisch, das aus dem kantabrischen Hinterland stammt.
Lokale Restaurants wie „La Lonja“, „El Restaurante de Emilia“ oder „Asador El Puerto“ servieren diese Spezialitäten in rustikalem Ambiente oder mit Blick auf das Meer. Saisonale Märkte und gastronomische Feste bieten weitere Gelegenheiten, die regionale Küche zu entdecken.