La gastronomía de Santa María de Cayón refleja la rica herencia agrícola de la región de Cantabria, con un enfoque en ingredientes frescos y de origen local. Los productos lácteos, especialmente los quesos, juegan un papel central en la gastronomía local. El Queso de Cantabria, un queso semiduro tradicional elaborado con leche de vaca, es una delicia que los visitantes deben probar. Los platos de carne, como los guisos elaborados con cordero o ternera de origen local, también son populares, ofreciendo comidas abundantes y reconfortantes, perfectas para el clima fresco de la región.
El marisco es otro punto destacado de la cocina local, gracias a la proximidad del pueblo a la costa cantábrica. El pescado fresco, los calamares y el pulpo se encuentran en muchos menús, a menudo preparados de manera simple con aceite de oliva, ajo y hierbas frescas. Una de las especialidades de la región es el sobao pasiego, un dulce esponjoso y mantecoso que suele disfrutarse con café o té.
Los visitantes de Santa María de Cayón encontrarán una variedad de restaurantes locales, desde tabernas rústicas que sirven comida tradicional hasta restaurantes más modernos que ofrecen un toque creativo a los clásicos de la región. También son comunes los festivales gastronómicos que celebran los productos locales, desde quesos hasta mariscos y pasteles.