Santoña está bien conectada con el resto de España, lo que facilita el acceso a la ciudad tanto para turistas como para organizadores de eventos. El aeropuerto más cercano es el de Santander, a unos 40 kilómetros de distancia, que ofrece vuelos tanto nacionales como internacionales. Desde el aeropuerto, se puede llegar a Santoña en coche o autobús en menos de una hora. También hay servicios regulares de autobuses desde ciudades cercanas como Santander y Bilbao, lo que proporciona un acceso fácil y cómodo.
Una vez en Santoña, la ciudad es fácilmente accesible a pie gracias a su tamaño compacto y a sus calles bien mantenidas. Para aquellos que deseen explorar los alrededores, hay servicios de autobús y taxis que permiten moverse por las localidades cercanas y atracciones turísticas. Además, el puerto de Santoña ofrece oportunidades para realizar viajes en barco y excursiones de pesca.
El sistema de transporte público de la ciudad es confiable, y para quienes buscan explorar la naturaleza circundante, las rutas de senderismo alrededor del monte Buciero están bien señalizadas y son accesibles para visitantes de todos los niveles.