La economía de Baena se basa principalmente en la agricultura, siendo la producción de aceite de oliva el principal motor económico de la ciudad. El aceite de oliva virgen extra de Baena es conocido mundialmente por su calidad y es uno de los productos más exportados de la región. El turismo relacionado con el aceite de oliva ha crecido en los últimos años, atrayendo a visitantes que desean conocer los métodos de producción tradicionales y disfrutar de degustaciones de este producto emblemático.
Además de la agricultura, el sector turístico ha experimentado un crecimiento constante, gracias al atractivo cultural e histórico de la ciudad. Las pequeñas empresas locales, incluidas tiendas de artesanía y mercados, también juegan un papel importante en la economía, ofreciendo productos únicos y auténticos de la región.
El vino es otra industria clave en la zona, con viñedos locales que producen vinos andaluces que complementan perfectamente la gastronomía de Baena.