La economía de Cistérniga ha estado históricamente ligada a la agricultura, gracias a su ubicación en una de las regiones más fértiles de España. El cultivo de cereales, uvas y hortalizas sigue siendo una de las principales actividades económicas de la zona. Además, la cercanía a la Ribera del Duero ha permitido que la industria del vino sea una parte importante de la economía local, con varias bodegas que producen vinos de renombre internacional.
En los últimos años, el sector servicios y la hostelería han crecido significativamente, impulsados por el aumento del turismo en la región y la organización de eventos locales. Esto ha generado nuevas oportunidades económicas, con la apertura de restaurantes, hoteles y otros negocios orientados al turismo. Además, la localidad alberga pequeños negocios artesanales que contribuyen a la economía local.