Lepe es fácilmente accesible por carretera, con importantes autopistas que conectan la ciudad con Huelva, Sevilla y Portugal. El aeropuerto más cercano es el Aeropuerto Internacional de Faro, en Portugal, a aproximadamente una hora en coche, lo que lo hace conveniente para los visitantes internacionales. El aeropuerto de Sevilla es otra opción, a unos 90 minutos de Lepe en coche.
Dentro de la ciudad, las opciones de transporte incluyen autobuses y taxis, aunque Lepe es una ciudad compacta y fácil de recorrer a pie, con la mayoría de las atracciones a poca distancia. Para aquellos que deseen explorar las áreas circundantes, el alquiler de coches es una opción popular, especialmente para visitar las playas cercanas o el hermoso campo de Huelva.
El transporte público es confiable y asequible, con servicios regulares de autobuses que conectan Lepe con los pueblos y playas cercanas.