San Juan del Puerto tiene una rica historia que se remonta a tiempos antiguos, influenciada por diversas culturas que han dejado una huella significativa en su identidad. La ciudad está profundamente conectada con su río, que ha sido utilizado como una importante ruta de transporte por civilizaciones como los romanos y, posteriormente, los moros. Los moros dejaron una huella indeleble en la arquitectura y la cultura de la zona, antes de que la ciudad fuera reconquistada por las fuerzas cristianas en el siglo XIII durante la Reconquista.
Una de las principales celebraciones culturales de la ciudad es la «Fiestas Patronales de San Juan Bautista», en honor a su patrón, San Juan Bautista. Este festival es un ejemplo vibrante de las costumbres andaluzas, con procesiones, música en vivo, bailes flamencos y una abundante oferta gastronómica. Otra festividad destacada es la «Romería del Rocío», una peregrinación que atrae a miles de personas hacia el cercano pueblo de Almonte, reflejando el profundo sentido de la devoción religiosa en la comunidad.
Entre los hitos históricos de la ciudad se encuentra la Iglesia de San Juan Bautista, construida en el siglo XV, un destacado ejemplo de la arquitectura gótico-mudéjar, que simboliza la fusión de las influencias cristianas y musulmanas en la región.