La economía de San Juan Despí es diversa y está muy influenciada por su cercanía a Barcelona. Las principales industrias incluyen la manufactura, la logística y la atención sanitaria. Varias empresas multinacionales han establecido sus sedes en la ciudad, especialmente en el ámbito de la investigación y la innovación médica, lo que ha convertido a San Juan Despí en un polo de atracción para profesionales y científicos.
El sector agrícola también tiene su relevancia, sobre todo en la producción de vinos y aceite de oliva de alta calidad, productos clave en la economía de la región catalana. La proximidad a las áreas agrícolas del Llobregat permite a San Juan Despí disfrutar de productos locales frescos que enriquecen su gastronomía.
En los últimos años, el sector servicios y la hospitalidad han crecido significativamente, ya que la ciudad se ha convertido en un destino emergente para eventos corporativos y turísticos. La combinación de industrias tradicionales y modernas hace de San Juan Despí una ciudad dinámica con oportunidades para negocios y desarrollo.