La economía de Bayona está impulsada principalmente por el turismo, con sus playas, monumentos históricos y eventos culturales atrayendo a visitantes durante todo el año. En particular, los meses de verano ven una afluencia de turistas nacionales e internacionales que buscan disfrutar de su entorno natural y de las actividades recreativas que ofrece.
La pesca también es una industria clave en Bayona, y su puerto sigue siendo un punto de actividad pesquera, suministrando mariscos frescos y pescado a los mercados locales y restaurantes de toda Galicia. Los mariscos como las ostras, almejas y mejillones son productos destacados, y la pesca artesanal sigue siendo una parte importante de la identidad económica de la ciudad.
Además del turismo y la pesca, en Bayona han florecido negocios locales como tiendas de artesanía, productos tradicionales gallegos y pequeños comercios que atienden tanto a los residentes como a los turistas. La artesanía local, como la cerámica y el encaje gallego, son productos muy valorados por los visitantes.