La economía de Molina de Segura ha estado tradicionalmente arraigada en la agricultura, con las tierras fértiles que rodean el río Segura utilizadas para el cultivo de frutas, verduras y aceitunas. Sin embargo, en los últimos años, la economía de la ciudad se ha diversificado, con un crecimiento en los sectores de la manufactura y la logística. La ubicación estratégica de la ciudad cerca de la capital regional, Murcia, y de las principales carreteras la convierte en un centro para el transporte y el comercio.
El turismo también está ganando importancia en la economía local, con visitantes atraídos por las ofertas históricas y culturales de la ciudad, así como por su proximidad a parques naturales y áreas costeras. Otro aspecto único de la economía de Molina de Segura es su artesanía tradicional, particularmente en cerámica y alfarería, que se produce aquí desde hace siglos.
La ciudad también alberga varios parques industriales que apoyan la manufactura de textiles, muebles y otros bienes. A medida que la ciudad sigue creciendo, se espera que estas industrias desempeñen un papel importante en su futuro económico.