La gastronomía de San Javier es un reflejo de los sabores ricos y variados de la Región de Murcia, influenciada por su proximidad al mar y su tradición agrícola. Uno de los platos más emblemáticos es el «caldero», un arroz cocinado con pescado fresco, acompañado de alioli. También es muy popular el «zarangollo», un revuelto de calabacín, cebolla y huevo, típico de la región.
Los mariscos tienen un lugar destacado en la cocina local, con platos como las sardinas a la parrilla, el pulpo a la plancha y los famosos «mariscos» (moluscos y crustáceos) que se sirven en muchos restaurantes. La ciudad también ofrece una amplia variedad de tapas, desde ensalada murciana hasta «michirones» (guiso de habas).
Para los amantes de los postres, los «paparajotes» son una delicia local, hechos de hojas de limonero rebozadas en masa y espolvoreadas con azúcar y canela. San Javier tiene una vibrante escena culinaria, con restaurantes que van desde tabernas tradicionales hasta locales de alta cocina.