La economía de Santomera se centra tradicionalmente en la agricultura, con el cultivo de cítricos (especialmente limones y naranjas) como su principal motor económico. Las fértiles tierras, irrigadas por antiguos sistemas introducidos durante el periodo musulmán, siguen produciendo frutas de alta calidad que se exportan tanto a nivel nacional como internacional. La producción de aceite de oliva también es una industria local destacada.
Si bien la agricultura sigue siendo la columna vertebral de la economía, en los últimos años ha habido un crecimiento en otros sectores, como la pequeña manufactura y los servicios relacionados con el turismo. La ciudad ha atraído más atención de los organizadores de eventos y turistas que buscan una experiencia española auténtica. Los mercados locales, las industrias alimentarias y la artesanía también juegan un papel importante en la economía local, haciendo de Santomera una ciudad donde los visitantes pueden degustar y comprar productos únicos.