La economía de Maliaño es diversa, con un enfoque tanto en la industria como en el turismo. La ciudad forma parte de la zona industrial más amplia que rodea Santander, con la fabricación y las industrias marítimas desempeñando roles significativos. El puerto local actúa como un centro logístico, mientras que industrias como la construcción naval, el transporte y la logística contribuyen a la actividad económica del área. El turismo, impulsado por la proximidad de la ciudad a las atracciones naturales y los sitios de patrimonio cultural, es otro sector en crecimiento.
Los productos locales únicos incluyen artesanías tradicionales, como cerámica y textiles, que se venden en los mercados locales o tiendas de artesanos. Además, la zona es conocida por su industria pesquera, proporcionando mariscos frescos a los restaurantes locales. Maliaño también se beneficia de su entorno agrícola, con granjas locales que producen productos lácteos frescos, verduras y frutas que se pueden disfrutar en los mercados y restaurantes de la ciudad.