Moralzarzal est située dans le nord-ouest de la Communauté de Madrid, en plein cœur du parc naturel de la Sierra de Guadarrama. Cette position géographique en fait un havre de paix naturel à proximité immédiate d’agglomérations majeures telles que Madrid, Collado Villalba et San Lorenzo de El Escorial. La ville est perchée à environ 979 mètres d’altitude, ce qui lui confère un microclimat montagnard très apprécié.
Entourée de paysages spectaculaires, la ville se trouve non loin du Mont Abantos et du parc régional de la Cuenca Alta del Manzanares, classé réserve de biosphère. Elle est traversée par plusieurs sentiers de randonnée et pistes VTT qui offrent une vue imprenable sur la nature environnante.
Le climat est de type méditerranéen continental, avec des étés chauds et secs, idéaux pour les activités de plein air, et des hivers froids avec parfois quelques chutes de neige, qui ajoutent au charme de la ville. Les meilleures périodes pour visiter sont le printemps (avril-juin) et l’automne (septembre-octobre), quand les températures sont agréables et les paysages particulièrement beaux.