San Sebastián de los Reyes est l’un des pôles économiques les plus importants du nord de Madrid. Elle abrite une zone industrielle active, des centres logistiques de grandes marques, ainsi que des entreprises de technologie, distribution, automobile et services. Des entreprises comme IKEA, Decathlon, Leroy Merlin ou Antena 3 ont leurs installations ou sièges dans la commune.
Le secteur tertiaire est dominant, en particulier le commerce, les services aux entreprises et l’hôtellerie-restauration. Le tourisme d’affaires y est en expansion grâce à la proximité de Madrid, aux infrastructures hôtelières modernes et à la connectivité routière et ferroviaire.
La ville soutient également l’entrepreneuriat à travers des espaces de coworking, des aides aux start-ups, et un centre d’innovation municipale qui favorise la transformation numérique et les projets durables.