Berja est facilement accessible par la route, via l’A-347 qui relie la ville à El Ejido, Adra et la côte méditerranéenne en moins de 30 minutes. La ville est à environ 55 km de l’aéroport d’Almería, qui offre des liaisons régulières avec Madrid, Barcelone, et plusieurs villes européennes.
Bien que Berja ne dispose pas de gare ferroviaire, des lignes de bus régulières relient la ville à Almería, El Ejido et d’autres communes de la région. Des taxis et des services de transport à la demande sont également disponibles.
À l’intérieur de la ville, les déplacements sont faciles à pied ou à vélo. Berja dispose d’un réseau de rues bien entretenu et de parkings pratiques pour les visiteurs. Des efforts sont en cours pour améliorer la mobilité durable et renforcer l’accessibilité pour les personnes à mobilité réduite.
Pour les événements, des services de transport privés peuvent être organisés en collaboration avec les prestataires locaux, ce qui facilite la logistique des congrès ou des festivals.