L’économie de Rota repose principalement sur le tourisme, l’agriculture et la présence de la base navale conjointe espagnole et américaine. Cette base est un employeur majeur dans la région et contribue significativement à l’économie locale.
L’agriculture joue également un rôle important, avec la culture de produits tels que les tomates, les poivrons verts et les citrouilles. Ces produits sont souvent mis en valeur lors de festivals et d’événements culinaires.
Le secteur de la pêche, bien que moins dominant qu’autrefois, reste actif, fournissant des produits frais aux marchés locaux et aux restaurants. La ville bénéficie également d’investissements dans les infrastructures portuaires pour soutenir cette activité.