Guadix est bien desservie par la route grâce à l’autoroute A-92, qui relie la ville à Grenade, Almería et Séville. Des lignes de bus régulières la connectent aux principales villes andalouses, et elle dispose également d’une gare ferroviaire avec des liaisons vers Grenade, Almería et Madrid.
L’aéroport le plus proche est celui de Grenade-Federico García Lorca, situé à environ une heure de route. L’aéroport d’Almería, également accessible, constitue une autre option pour les visiteurs internationaux.
À l’intérieur de la ville, les déplacements peuvent se faire aisément à pied ou en voiture, avec un stationnement relativement facile et peu de trafic. Des taxis et des lignes de bus urbains facilitent également la mobilité locale.