L’économie de San Juan de Aznalfarache repose principalement sur les services, le commerce local, l’éducation et l’administration. Grâce à sa proximité immédiate avec Séville, de nombreux habitants travaillent dans la capitale, mais la ville développe également sa propre offre économique.
Le commerce de détail est bien représenté avec des marchés, des boutiques indépendantes, des cafés et des restaurants. Le secteur de la construction a également connu une croissance significative ces dernières années, avec de nouveaux quartiers résidentiels.
L’artisanat local est encore vivant, notamment dans le domaine de la céramique, de la gastronomie et de la couture. La ville accueille régulièrement des foires artisanales et des marchés de producteurs.
Le développement du tourisme culturel et religieux devient un axe de croissance pour la municipalité, grâce à sa situation stratégique et à son patrimoine.