San Juan de Aznalfarache se trouve sur la rive droite du fleuve Guadalquivir, à seulement 4 km du centre de Séville. Elle appartient à la comarque du Aljarafe, connue pour ses collines, ses oliveraies et ses paysages ouverts sur la vallée.
La ville est bien desservie par les transports en commun et les axes routiers qui la relient aux principales villes de la région. Les communes voisines incluent Tomares, Mairena del Aljarafe et Gelves, formant un pôle résidentiel dense autour de Séville.
Le climat est typiquement méditerranéen avec des influences continentales. Les étés sont chauds et secs, avec des températures atteignant régulièrement les 35 °C, tandis que les hivers sont doux, avec des minimales rarement en dessous de 7 °C. Le printemps et l’automne sont des saisons particulièrement agréables pour visiter.
La lumière abondante et le climat ensoleillé presque toute l’année font de San Juan un endroit propice aux activités en plein air, aux festivals et aux événements culturels.