L’économie de Santa Margalida repose principalement sur l’agriculture, le tourisme et les petits commerces locaux. La culture des amandes, des figues, des caroubes et de l’orge reste encore active, tout comme l’élevage de brebis et la production d’huile d’olive artisanale.
Le tourisme rural est en forte croissance, avec des agrotourismes et fincas transformées en hébergements de charme, attirant un public désireux de découvrir un autre visage de Majorque, loin des grandes stations balnéaires. L’artisanat local, notamment la céramique et le tissage traditionnel, connaît aussi un regain d’intérêt.
La proximité avec Can Picafort, station très fréquentée en été, permet à Santa Margalida de bénéficier indirectement d’une activité touristique saisonnière, sans en subir les excès. Des marchés hebdomadaires et des événements gastronomiques animent également l’économie locale.