L’économie de Cistérniga repose principalement sur le secteur tertiaire, les services et les petites industries. Son développement comme ville résidentielle a entraîné une expansion de l’offre commerciale, éducative et de santé. Elle abrite également plusieurs zones industrielles, avec des entreprises de logistique, de construction, de transport et d’agroalimentaire.
La commune est aussi liée au secteur agricole, notamment avec la culture de céréales, de tournesol et la viticulture dans les environs. Les produits agricoles locaux, bien que produits en petite quantité, sont valorisés par les marchés locaux et les restaurants de proximité.
Cistérniga bénéficie également de son intégration dans l’économie métropolitaine de Valladolid, permettant aux résidents de travailler dans la ville voisine tout en profitant d’un cadre plus calme et abordable.