Almendralejo est facilement accessible grâce à sa position stratégique entre Mérida et Zafra, sur la route nationale N-630 (appelée aussi « la Ruta de la Plata ») et à proximité de l’autoroute A-66, qui relie Séville au nord de l’Espagne. Cela permet un accès rapide en voiture depuis plusieurs grandes villes espagnoles.
La ville dispose également d’une gare ferroviaire desservie par les lignes régionales RENFE, reliant directement Mérida, Badajoz, Séville et Madrid. Un réseau de bus régionaux assure également les liaisons avec les communes voisines.
Almendralejo ne possède pas d’aéroport propre, mais bénéficie de la proximité de l’aéroport de Badajoz (à 50 km), qui propose des vols nationaux, et de celui de Séville (à 150 km), offrant un éventail plus large de connexions internationales.
La ville est bien organisée pour les déplacements urbains, avec un système de bus local, des taxis, ainsi que des rues et places piétonnes propices à la marche et au vélo, ce qui en fait une ville agréable à parcourir.